张泽民

张泽民

张泽民(Zhang Lab),[0]男,1967年7月出生于中国河南省驻马店市驿城区,[1]1995年于美国宾州州立大学获得生物化学和分子生物学专业博士学位,[3]获得博士学位后,张泽民在美国旧金山加州大学进行博士后研究工作至1998年。[4]曾任北京大学生命科学学院教授,北京大学生物医学前沿创新中心研究员、副主任,北京大学未来基因诊断高精尖创新中心研究员,北大—清华生命科学联合中心高级研究员。现任重庆医科大学校长。[5]张泽民1988年本科毕业于南开大学生物系, 1989年赴美国宾州州立大学留学 ;[3]1998年到2014年,在医药公司基因泰克/罗氏工作,2014年加入北京大学,2022年3月起担任北京大学生物医学前沿创新中心(BIOPIC)主任, [1][3]致力于应用机器学习和高通量测序等高新技术进行抗癌药靶和生物标记物的发现。通过对癌症高通量数据的分析, 成功地发现了多种特异性抗癌靶点, 获得60多项美国专利授权。[3]

张泽民(Zhang Lab),[1]男,1967年7月出生于中国河南省驻马店市驿城区[2]1995年于美国宾州州立大学获得生物化学和分子生物学专业博士学位,[4]获得博士学位后,张泽民在美国旧金山加州大学进行博士后研究工作至1998年。[5]曾任北京大学生命科学学院教授,北京大学生物医学前沿创新中心研究员、副主任,北京大学未来基因诊断高精尖创新中心研究员,北大—清华生命科学联合中心高级研究员。现任重庆医科大学校长。[6]

张泽民1988年本科毕业于南开大学生物系, 1989年赴美国宾州州立大学留学 ;[4]1998年到2014年,在医药公司基因泰克/罗氏工作,2014年加入北京大学,2022年3月起担任北京大学生物医学前沿创新中心(BIOPIC)主任, [2][4]致力于应用机器学习和高通量测序等高新技术进行抗癌药靶和生物标记物的发现。通过对癌症高通量数据的分析, 成功地发现了多种特异性抗癌靶点, 获得60多项美国专利授权。[4]

2020年入选Cell学术顾问委员会成员。[2]相关成果入选2017年度中国十大医学科技新闻、中国生命科学十大进展;细胞出版社2017和2019中国年度论文、2018和2019年度中国生物信息十大进展、2020年细胞杂志最佳论文。[4]2023年11月当选为中国科学院院士。[7]

早期经历

张泽民于1967年7月出生于驻马店市驿城区[2]1988年本科毕业于南开大学生物系, 1989年由 CUSBEA 项目赴美留学。1995年研究生毕业于宾州州立大学生物化学和分子生物学专业, 获得博士学位 ;[4]期间在加州大学伯克利分校获得了IT技术的训练;[2]1995-1998年在美国旧金山加州大学进行博士后研究工作。[4]

工作经历

1998年到2014年,任职于美国GENENTECH 公司开始生物信息学研究,,获得60多项美国专利授权;曾任博士后导师, 生物信息学部主任, 生物信息首席科学家;[4]致力于应用机器学习和高通量测序等高新技术进行抗癌药靶和生物标记物的发现,[2]2014年,应现任北京大学生物医学前沿创新中心主任谢晓亮之邀,[8]加入北京大学,任北京大学生物医学前沿创新中心(BIOPIC)与北京未来基因诊断高精尖创新中心(ICG)研究员,北京大学生命科学学院讲席教授,北大-清华生命科学联合中心(CLS)高级研究员。[2]

2017年获The Boehringer Ingelheim Investigator Award,和Bayer Investigator Award,相关成果入选2017年度中国十大医学科技新闻、2017年度中国生命科学十大进展;获得细胞出版社2017和2019中国年度论文、2018和2019年度中国生物信息十大进展、2020年细胞杂志最佳论文;[3]2020年,入选Cell学术顾问委员会成员;2022年3月起担任BIOPIC主任。 [2]2025年任重庆医科大学校长。[6]

张泽民实验室团队成员与美国宾州大学John Wherry教授合影
张泽民实验室团队成员与美国宾州大学John Wherry教授合影

研究成果

张泽民教授长期聚焦肿瘤生物信息学研究,以“赋能新技术、启迪新概念、助力新医学”的生物信息理念,利用学科交叉优势引领肿瘤研究前沿。[9]在计算癌症生物学和癌症基因组学的多个方向上都是开拓者、引领者,完成了世界首例肿瘤全基因组测序[2]张泽民及其团队陆续在 Cell、Nature、Science 上发表了一些有关肿瘤异质性的文章,揭示了肿瘤内部确实存在很多细胞类型,而这些细胞在肿瘤外是不存在或者存在非常稀少的。[10]首次实现肿瘤微环境的大规模泛癌种单细胞分析,揭示了肿瘤的特有细胞组分,开创了从“全局”视角系统性研究肿瘤异质性的新方向;相关成果获得行业内高度认可,4次入选中国生物信息学十大进展,获中国生命科学领域十大进展和北京市科学技术奖自然科学奖一等奖(2020);[9]拥有60项美国以及众多欧洲专利,其中有7项药物已进入临床试验,[10]并在多项癌症治疗药物的分子靶标的原创发现中做出了直接贡献。目前承担了国家自然科学基金重点项目,任国家精准医学重大专项首席科学家。[11]

2018年6月26日,张泽民课题组在《Nature Medicine》发表论文,通过非小细胞肺癌12,346个T细胞的单细胞测序及分析,发现了可能的肺癌新靶点。这是《Nature Medicine》迄今发表过的针对肿瘤相关T细胞的规模最大的单细胞组学研究。[12][13]

2018年10月30日,国际顶级期刊《Nature》发表了张泽民课题组与美国安进公司(Amgen)欧阳文军团队及北京大学人民医院申占龙课题组合作的论文,该论文对12例结直肠癌患者的癌组织,癌旁组织以及外周血的大量T细胞进行全长转录组的深度测序,创造性地开发了STARTRAC (Single T-cell Analysis by Rna-seq and Tcr TRACking)生物信息方法,对结直肠癌相关T细胞的组织分布特性、克隆性、迁移性和状态转化进行全面刻画;首次从单细胞层面解析基因组微卫星不稳定(Microsatellite instable, MSI)和微卫星稳定(Microsatellite stable, MSS)结直肠癌病人的T细胞亚型及分子差异,并对多癌种的T细胞进行比较分析。[14]

张泽民教授课题组在《Nature》发布重大研究成果
张泽民教授课题组在《Nature》发布重大研究成果
张泽民教授课题组在《Nature Medicine》发布重大研究成果
张泽民教授课题组在《Nature Medicine》发布重大研究成果

研究方向

主要的研究方向包括:一,应用单细胞测序技术来研究肿瘤微环境特别是肿瘤浸润免疫细胞的精确组成、相互作用、以及功能状态;二,研究肿瘤的异质性、基因组机制、及其对耐药性的影响;三,开发原创的生物信息学工具和数据库,来进行单细胞基因组数据和癌症基因组大数据的整合、分析和可视化,以揭示癌症的亚型、驱动基因以及其他致癌因素的遗传基础,从而发现新型癌症靶点和标记物。[1]

主要论文与著作

时间论文
2021年肿瘤浸润髓系细胞的泛癌单细胞转录图谱
2021年解码抗肿瘤免疫的遗传基础
2021年大规模单细胞转录组图谱揭示的COVID-19免疫特征
2020年用于评估单细胞群纯度的基于shāng的指标
2020年基于配体受体介导的自组装的单细胞RNA测序数据重建细胞空间组织
2020年多发性骨髓瘤进展中的逐步免疫改变
2020年单细胞分析为结肠癌髓样靶向治疗的机制提供信息
2020年SciBet作为一种便携式和快速的单细胞类型标识符
2020年癌症中RNA改变的基因组基础
2020年全基因组的泛癌分析
2020年对1220种癌症的高覆盖率全基因组分析揭示了数百个基因因重排介导的顺式调节改变而失调
2020年未来十年癌症研究路线图
2020年全基因组DNA甲基化分析揭示结直肠癌患者肿瘤反应性CD8+T细胞的独特表观遗传特征
2020年癌症免疫治疗的历史与进展:了解肿瘤浸润免疫细胞的特征及其治疗意义
2019年单细胞RNA测序数据单核苷酸变异检测方法的系统比较分析.基因组生物学
2019年肝细胞癌中单个免疫细胞的景观和动力学
2019年应激-糖皮质激素-TSC22D3轴损害治疗诱导的抗肿瘤免疫
2019年hCINAP调节DNA损伤反应并介导急性粒细胞白血病细胞对治疗的抵抗力
2019年用于大规模表达谱分析和交互式分析的增强型Web服务器
2019年通过单细胞RNA测序重新表征肿瘤浸润淋巴细胞
2018年谱系追踪揭示了结直肠癌中T细胞的动态关系
2018年通过单细胞测序对非小细胞肺癌中的T细胞进行整体表征
2018年通过单细胞测序了解肿瘤生态系统:前景和局限性
2017年单细胞测序揭示肝癌浸润性T细胞的景观
2017年GEPIA:用于癌症和正常基因表达谱分析和交互式分析的Web服务器
2016年使用基因组方法了解癌症耐药性的遗传机制
2015年人类癌细胞系的综合转录图谱
2014年肝细胞癌基因组改变的多种模式
2014年整合外显子组和转录组测序揭示了ZAK亚型在胃癌中的使用
2014年MBASED在癌组织和细胞系中的等位基因特异性表达检测
2012年肝癌的基因组图谱
2012年肺癌的基因组和转录组测序揭示了不同的突变和剪接事件
2012年结肠癌中的复发性R-spondin融合
2012年乙型肝炎病毒整合到肝细胞癌患者基因组中的影响
2010年肺癌患者的配对基因组序列揭示的突变谱
2010年人类癌症中不同的体细胞突变模式和通路改变
2008年蛋白质结构和功能特性的自然选择:SNP视角
2007年DUBA:一种调节I型干扰素产生的去泛素化酶
2007年人类乳腺癌和结直肠癌的基因组景观
2007年结合位点排列和组合靶向在microRNA抑制基因表达中的作用
2007年CanPredict:一种用于预测错义癌症相关突变的计算工具
2007年GeneHub-GEPIS:基于集成基因数据库的正常和癌症组织的数字表达谱分析
2007年区分癌症相关的错义突变和常见的多态性
2007年GEPIS – 正常和癌症组织中的定量基因表达谱分析
2004年Human De-etiolated-1通过组装CUL4A泛素连接酶来调节c-Jun
2003年通过转录组分析对肿瘤表达增加的染色体区域进行全基因组鉴定
参考资料[3]

社会职务

时间职务
2020年[2]入选Cell学术顾问委员会成员
2018年[10]百奥智汇科技有限公司创始人

荣誉奖项

获奖时间奖项名称获奖情况
2023年11月中国科学院院士获奖
2022年中国生物信息学十大进展获奖
2021年细胞出版社2021中国年度论文获奖
2021年中国生物信息学十大进展获奖
2020年北京市自然科学一等奖获奖
2020年细胞杂志最佳论文获奖
2019年中国生物信息学十大进展获奖
2019年中国生物信息学十大应用获奖
2019年细胞出版社2019中国年度论文获奖
2019年拜耳研究者奖获奖
2018年细胞出版社2018中国年度论文获奖
2018年中国生物信息学十大进展获奖
2017年细胞出版社2017中国年度论文获奖
2017年年度科学中国人获奖
2017年年度中国十大医学科技新闻获奖
2017年年度中国生命科学十大进展获奖
2017年The Boehringer Ingelheim Investigator Award获奖
2017年北京大学转化研究个人奖获奖
2017年长江学者(教育部)获奖
2012年Genentech Billboard (形象科学家“To us, science is personal”)获奖
2005年Genentech 年度报告科学家获奖
1989年CUSBEA 学者(China-US Biochemistry Exchange and Application Program)获奖
不详Genentech 特殊贡献奖 (multiple times)获奖
不详教育部长江特聘教授获奖
不详中组部海外高层次人才获奖

参考资料[1][15][16]

人才培养

2023年9月12日,张泽民出席南开大学生命科学学院迎新大会,用亲身经历鼓励同学们不要惧怕挫折与困难,失败才能积累经验,有成有败才能谓之科研、才能谓之开拓。强调要做自己想做的事并要敢尝试、多尝试、多积。[17]

人物评价

张泽民教授长期致力于应用高通量测序和生物信息学等高新技术进行肿瘤基因组学和肿瘤免疫的研究,在计算癌症生物学、癌症基因组学和肿瘤免疫等多个研究方向上做出了国际开拓、引领性的工作。[18]北京大学生命科学学院评)

张泽民在“单细胞测序技术”“泛癌数据挖掘”等方面作出的突出贡献,可以说无人可比。[19]驻马店网评)

参考资料 19

  1. Cancer PKU Zhang Group – Peking University — Peking University
  2. 驻马店籍学术大咖张泽民入选2023年两院院士增选有效候选人名单 — 澎湃新闻
  3. 北京大学生命科学学院 — 北京大学
  4. 北京大学生命科学学院 — 北京大学生命科学学院官网
  5. 张泽民研究员荣获2020年度北京市科学技术奖-自然科学奖一等奖 — 北京大学生物医学前沿创新中心
  6. 院士出任大学校长! — 光明社教育家-今日头条
  7. 关于公布2023年中国科学院院士增选当选院士名单的公告 — 中国科学院
  8. 肿瘤研究学者访谈 | 北京大学张泽民:心之所向,素履以往 — 北京大学
  9. 北大新晋院士 — 半月谈
  10. 北京大学张泽民教授:利用单细胞测序发现肿瘤微环境差异,推动精准医学向前发展 — BIPIC
  11. 张泽民 — 北京大学
  12. 独家专访中国学者《Nature》子刊发布最大规模肺癌T细胞单细胞免疫图谱 — 微信公众平台
  13. 今晨《Nature》,独家专访中国学者发布最全面深入结直肠癌T细胞动态变化图谱 — 基因慧
  14. 张泽民组与合作者在《Nature》发文建立基于TCR的生物信息追踪方法,揭示结直肠癌T细胞动态变化图谱 — 北京大学前沿交叉学科研究院
  15. 关于公布2023年中国科学院院士增选当选院士名单的公告 — 中国科学院
  16. Zemin Zhang — BIPIC
  17. 生命科学学院特邀张泽民博士开展“校友大咖面对面”访谈 — 南开大学新闻网
  18. 生物医学前沿创新中心张泽民实验室招聘生物信息学研究助理 — 北京大学生命科学学院
  19. 新晋中国科学院院士张泽民的科技传奇 — 澎湃新闻
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