演化关系
非洲兽总目的成立主要是基于分子及DNA分析。于1990年代前的基因分析将非洲兽总目看为真兽下纲下的四个大类之一,而它们之间的关系却倍受争议。其中一个学说指非洲兽总目与其他三个分支是最古老的分裂,发生于一亿零五百万年前非洲从主要大陆分裂时。基因分析及化石纪录显示贫齿总目是在南美洲演化,并分化成劳亚兽总目及超灵长总目(亦称真祖兽睡鼠总目)。劳亚兽总目及超灵长总目之间较为接近,并组成北方兽类(Boreoeutheria)。
一些学者认为这个分类是初步或受争议的,因为这个分类往往忽略了以往形态学的分类。例如食虫目原是包含了多种细小及吃昆虫的哺乳动物,拥有因趋同演化的相似解剖及行为,但现今则被分开了。不同形态特征的贫齿总目引渡了学者将所有其他真兽下纲都分类到上兽类,而贫齿总目则被视为最远的分类。但是另一项研究则将贫齿总目及非洲兽总目结合在大西洋兽类中。
现时状况
很多非洲兽总目的成员都是濒临灭绝的。若这个分类成立的话,这可能是遗传学及演化多样性上的重大损失。非洲兽总目包含了差不多非洲及马达加斯加三分之一的哺乳类下的目,但这些目下的1200多个物种中只有75种是生活在这些地区。虽然很多现存的非洲兽总目物种都生活在非洲,但仍有一些是在其他地方发现,共通点则是它们都是濒危的。
分类
非洲兽总目是真兽下纲下的一个分类,其下现存有六个目:
• 劳亚兽总目(Laurasiatheria)
• 灵长总目(Euarchontoglires)
• 蹄兔目(Hyracoidea):约4-6个物种,视乎亚种的分类。
• 长鼻目(Proboscidea):共3个物种。
• 海牛目(Sirenia):共4个物种。
• †重脚目(Embrithopoda)
• †索齿兽目(Desmostylia)
• 象鼩目(Macroscelidea):共15个物种。
• 管齿目(Tubulidentata):只有1个物种,即土豚。
• 金毛鼹亚目(Chrysochloridea):共21个物种。
• 马岛猬亚目(Tenrecomorpha):共32个物种。
• 非洲猬目(Afrosoricida)
• 非洲食虫类(Afroinsectiphilia)
• 假有蹄类(Pseudungulata)
• 近蹄类(Paenungulata)
• 非洲兽总目(Afrotheria)
• 北方兽类(Boreoeutheria)