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组织相容性（histocompatibility）是指不同个体间组织或器官移植时，供、受体双方相互接受的程度。相容性越高，免疫系统的反应程度越低，甚至没有免疫或排斥反应发生。两个不同个体之间的相容性由其细胞的MHC序列决定，这些序列源自父母的染色体。
20世纪40年代已发现，小鼠近交系之间皮肤移植物的排斥由分布在不同染色体上的多个基因决定。这时候，人们把代表个体特异性的同种抗原称为移植抗原或组织相容性抗原。机体参与排斥反应的抗原系统很多，其中能引起强而迅速排斥反应的抗原被称为主要组织相容性抗原（MHC分子）。
基本概念
主要组织相容性复合体（MHC）：是脊椎动物某一染色体上编码主要组织相容性抗原、控制免疫细胞间相互识别、调节免疫应答的一组紧密连锁的基因群。
结构
MHC结构十分复杂，显示多基因性和多态性。多基因性指复合体由多个紧密相邻的基因座位所组成，编码产物具有相同或相似的功能。
基因特性
经典的Ⅰ类基因和经典的Ⅱ类基因，他们的产物具有抗原提呈功能，丰富多态性，直接参与T细胞的激活和分化，参与调节适应性免疫应答。免疫功能相关基因，包括传统的Ⅲ类基因及新近确认的多种基因，无多态性或有限多态性，主要参与调控固有免疫应答。
经典的MHCⅠ类基因和Ⅱ类基因（如下图）：
