马飞

马飞，男，博士，南京师范大学生命科学学院教授，博士生导师。《Journal of Biological Systems》杂志编委，江苏省生物医学工程学会生物信息学专业委员会委员，江苏省动物学会理事，美国遗传学会会员。2007年入选教育部新世纪优秀人才。主要从事功能基因与分子进化、比较基因组学与生物信息学等研究。

2008年8月至今，南京师范大学生命科学学院特聘教授。

2004年8月至2008年8月，辽宁师范大学生命科学学院特聘教授。

2003年9月至2004年7月，厦门大学生命科学学院副教授。

2001年9月至2003年8月，清华大学生物信息研究所博士后, 合作导师李衍达院士。

1998年9月至2001年7月，南京农业大学学习，获博士学位，导师程遐年教授。

1990年7月至1998年8月，安徽省白湖农科所，助理农艺师、农艺师。

1986年9月至1990年7月，安徽农学院学习，获学士学位，导师邹运鼎教授。

1. 《 Journal of Biological Systems》杂志编委；

2. 《 Human Mutation》、《 Journal of Theoretical Biology》等国际杂志审稿人；

3. 江苏省生物医学工程学会生物信息学专业委员会委员，江苏省动物学会理事，清华生物信息与精准医学分会理事，美国遗传学会会员。

已主持国家自然科学基金、教育部“新世纪优秀人才支持计划”、863计划专题、973计划子课题以及国家转基因生物新品种培育重大科技专项子课题10余项。在Molecular Biology and Evolution, Bioinformatics, BMC Evolutionary Biology, FEBS Letters, Developmental & Comparative Immunology, Fish & Shellfish Immunology, Mutation Research等国际重要学术刊物上发表SCI收录论文50余篇。参编学术著作和教材三部。获省部级自然科学和科技进步奖各一项。已申请国家发明专利1项。^[1]

1 MicroRNA及选择性剪接基因（Alternatively Spliced Gene）的分子进化与功能研究

采用分子生物学、比较基因组学以及生物信息学的理论与技术研究microRNA及选择性剪接基因及其基因家族的分子进化，重点研究microRNA在文昌鱼和海鞘发育和免疫中的功能和作用机制，并注重利用RNAi技术研究选择性剪接的可能机制及其基因不同变体的功能。

2 比较基因组学（Comparative Genomics）

比较基因组学是通过对系统发育进化中重要物种基因和基因家族的比较分析，构建系统发育的遗传图谱，揭示基因、基因家族的起源和功能及其在进化过程中复杂化和多样化产生的机制。我们研究组基于模式生物基因组的信息，采用DNA芯片和gDNA文库、EST分析、基因重组与克隆、基因序列分析等方法和技术，开展基因和基因家族的进化、结构与功能的关系、人类疾病基因识别与功能等方面的研究。目的是了解所有基因和基因家族在基因组中的分布以及在演化进程中所产生的变化及其遵循的规律。

3 功能基因的克隆与表达

利用基因组学、蛋白质组学、生物信息学的技术与方法以及高效能表达克隆技术，系统地开展抗逆、抗病以及疾病等相关基因的高通量筛选与鉴定研究，目的是筛选和鉴定一批拥有自主知识产权的与抗逆、抗病以及经济性状基因相关的功能基因。

4 生物信息学（Bioinfomatics）

① 生物信息数据库及软件开发；

② 生物信息知识发现与数据挖掘；

③ 基因调控网络。

1. 教育部新世纪优秀人才支持计划项目（No. NCET-07-0405）：文昌鱼microRNA基因及其靶标的识别与比较基因组研究，2008~2010。

2. 国家自然科学基金（No. 30970348）：脊椎动物miRNA基因的起源与进化分析， 2010~2012。

3. 国家转基因生物新品种培育科技重大专项子课题项目（2009ZX009-063B）：抗寒/抗旱相关基因的生物信息学分析及功能验证，2009~2010。

4. 国家重点基础研究发展计划（973计划）子课题（No. 2010CB126206）：稻田生态系统对稻飞虱种群数量调控功能及机制， 2010~2014 (参加)。

5. 国家自然科学基金（No. 60575005）：可变剪接基因的模式识别与克隆验证，2006~2008。

6. 国家自然科学基金（青年基金）（No.60305001）：真核生物选择性剪接基因起源与进化的生物信息学研究，2004~2006。

7. 国家高技术研究发展计划（No. 2007AA09Z428）：七鳃鳗药用相关基因的筛选、鉴定与功能研究，2008~2010（副组长）。

8. 辽宁省高等学校优秀人才支持计划项目（No. 2006R32）：文昌鱼miRNA基因及其靶标的识别与比较基因组研究，2007~2009。

9. 辽宁省自然科学基金(No. 20072152)：基于生物信息技术的七鳃鳗免疫基因挖掘与功能研究，2008~2010。

1. 程遐年，吴进才，马飞 编著. 《褐飞虱的研究与防治》. 北京：中国农业出版社. 2003年9月（本书获2002年国家科学技术学术著作出版基金的专项出版资助）。

2. 李庆伟，马飞 编著.《鸟类分子进化与分子系统学》. 北京：科学出版社. 2007年8月。

3. 马飞（参编）等. 十一五《生物信息学》教材. 北京：中国农业出版社. 2006年10月。

1. Song S, Guo J, Li-Ling J, Huang Q, Chen X, Ma F*. Comparative component analysis of exons with different splicing frequencies. PLoS ONE, 2009, 4(4): e5387. doi:10.1371/journal.pone.0005387.

2. Ma X, Huang Q, Li-Ling J, Hou L, Ma F*. Systematic analysis of alternative promoters correlated with alternative splicing in human genes. Genomics, 2009, 93: 420-425

3. Liu X, Li-Ling J, Hou L， Li Q , Ma F*. Identification and characterization of a chitinase-coding gene from Lampetra japonicawith possible roles in gonadal development and innate immunity. Developmental and Comparative Immunology, 2009, 33（2）：257-263.

4. Huang Q, Guo J, Ge Q, Li-Ling J, Chen X, Ma F*. Comparative analysis of distinct noncoding characteristics potentially contributing to the divergence of human tissue-specific genes. Genetica, 2009, 136(1):127-134.

5. Zhou L, Li-Ling J, Huang H, Ma F*, Li Q*. Phylogenetic analysis of vertebrate kininogen genes. Genomics, 2008, 91(2):129-141.

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19. Ma F*, Zhuang Y, Li Y, Xu X, Chen X. Usage Patterns of Codons versus Complementary Codons among Cellular Organisms and Organelles. Journal of Biological Systems, 2003, 11(4):407~418.

20. Zhuang Y, Ma F*, Li-Ling J, Xu X, Li Y. Comparative analysis of amino acids usage and protein length distribution of alternatively and non-alternatively spliced genes across the six eukaryotic genomes. Molecular Biology and Evolution, 2003,20（12）：1978~1985.

1. 入选2007年度教育部新世纪优秀人才支持计划；

2. 入选2006年度辽宁省优秀人才支持计划；

3. 入选2006年度辽宁省高等学校优秀青年骨干教师。