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人物经历
吴清友1950年10月出生于台南县将军乡马沙沟平沙村，家中排行第四，共有九位兄弟姊妹。他的父亲吴寅卯在战后初期赴台南府经商，家境由清贫转为小康。吴清友在就读台南初中期间，寄宿在外，成绩并不理想。在这段期间，他的父亲因为为人作保而破产。
吴清友考入台南高工学习，由于患有先天性心脏扩大症而免役。毕业后，他先进入职场，后来因为对前途的考虑，决定在台南市寄宿以补习，用了三年时间录取台北工专二专部。
吴清友在毕业后曾在职业技术中学当过教师、于皮包工厂打工，之后进入专营饭店餐厨设备与咖啡机的诚建公司里当业务员。31岁时，他接下诚建公司的股权，成为负责人。在他的努力下，39岁时，他的餐旅厨房设备事业已居业界领先地位。
1988年11月28日，吴清友因先天性心脏扩大而动刀后，读著弘一法师传记，思考人生定位，决定要成立一家他理想中的书店。1989年3月12日，位于敦化南路口圆环旁的诚品书店开幕。1995年，吴清友相中诚品敦南店现址，但房东新光集团已与新光三越百货签租，于是透过市长陈水扁出面，终于让诚品书店在敦化南路成立旗舰店。1999年3月13日，诚品书店敦南店开始实施24小时经营。
个人生活
吴清友在台北工专与铭传商专合办毕业舞会上，对外校的洪肃贤一见钟情，进而结婚。两人学生时代，便已接触藏传佛教。他们有一子一女，长子吴威廷在高中时成了问题学生，因滋事被学校教官和少年队与约谈，一度紧张到要脱离父子关系。2009年4月，吴威廷在家中昏迷，虽吴清友急作CPR，依然骤逝。