陈士林

中国中医科学院中药研究所所长

陈士林

陈士林，男，1961年11月出生于湖北省荆门市[2]，博士，中国工程院院士、中国医学科学院学部委员、国际欧亚科学院院士，现任成都中医药大学首席教授、中国中医科学院首席研究员、CGCM（中药全球化联盟）副主席、中国质量协会中药分会会长等职。[0][1]陈士林1978年到1982年就读于湖北中医药大学中药学专业。[3][4]硕士、博士均毕业于成都中医药大学。[1]2013年2月，陈士林被聘任为中国中医科学院首席研究员；[5]2015年4月，当选国际欧亚科学院中国院士；[6]2022年10月，分别当选为俄罗斯工程院和俄罗斯自然科学院外籍院士；[7]2023年11月22日，陈士林当选中国工程院院士。[1]他首创核了基因组序列ITS2作为中草药通用DNA条形码的鉴定技术体系；创立“本草基因组学”学科，开发药用动/植物高通量混合测序的全基因组组装及拼接技术并成功突破复杂基因组组装难题；通过全基因组解析提出灵芝为首个中药基原药用模式真菌；完成并发表人参、丹参、赤芝等全基因组图谱和相关组学研究。建立了全世界规模最大的药用植物种质迁地保护专业平台。[1][8]

陈士林，男，1961年11月出生于湖北省荆门市[3]，博士，中国工程院院士、中国医学科学院学部委员、国际欧亚科学院院士，现任成都中医药大学首席教授、中国中医科学院首席研究员、CGCM（中药全球化联盟）副主席、中国质量协会中药分会会长等职。[1][2][注1]

陈士林1978年到1982年就读于湖北中医药大学中药学专业。[4][5]硕士、博士均毕业于成都中医药大学。[2]2013年2月，陈士林被聘任为中国中医科学院首席研究员；[6]2015年4月，当选国际欧亚科学院中国院士；[7]2022年10月，分别当选为俄罗斯工程院和俄罗斯自然科学院外籍院士；[8]2023年11月22日，陈士林当选中国工程院院士。[2]他首创核了基因组序列ITS2作为中草药通用DNA条形码的鉴定技术体系；创立“本草基因组学”学科，开发药用动/植物高通量混合测序的全基因组组装及拼接技术并成功突破复杂基因组组装难题；通过全基因组解析提出灵芝为首个中药基原药用模式真菌；完成并发表人参、丹参、赤芝等全基因组图谱和相关组学研究。建立了全世界规模最大的药用植物种质迁地保护专业平台。[2][9]

陈士林获国家发明专利和美国专利授权38项，发表论文500余篇，其中SCI论文300余篇，包括国际著名期刊Nature Plants， Nature Communications， PNAS等，论文被引用3万余次。[9]陈士林曾获国家科技进步二等奖2项、中华中医药学会自然科学一等奖、教育部高校成果科技进步一等奖等奖项，[10]并于2020年5月获得第二届全国创新争先奖奖章。[11]

人物经历

陈士林，1961年11月生，1978年毕业于荆门市龙泉中学。1978年到1982年就读于湖北中医药大学中药学专业。[4][5]硕士、博士均毕业于成都中医药大学。[2]

2013年2月16日，陈士林被聘任为中国中医科学院首席研究员。[6]

2015年4月25日，在国际欧亚科学院中国院士第十八次全体代表大会上，中国中医科学院中药研究所所长陈士林首席研究员当选为国际欧亚科学院中国院士。[7]

第七届世界卫生组织（简称WHO）传统医药合作中心主任会议，于2015年6月8日至10日在意大利萨尔索马焦雷镇举办。中国中医科学院中药研究所所长陈士林研究员作为合作中心主任，应邀参加此次会议。会上，他介绍了中心完成WHO委托任务、在传统医药领域与WHO及其他合作中心进行合作、发挥辐射作用等情况。[12]

在2017年5月12日开幕的2017中国西部生物医药大会上，中国中医科学院中药研究所所长陈士林以《大健康背景下中医药国际化策略选择》为题进行了主题演讲。[13]

受中国香港特别行政区政府创新科技署邀请，中国中医科学院中药研究所陈士林研究员于2017年9月11日至13日参加“香港中药研发研讨会2017”并作为主题演讲嘉宾做大会报告。[14]

2021年10月28日上午，上海中医药大学中药学院系列学术讲座之“科技创新与中药材品质提升工程”讲座举行。主讲人中国中医科学院陈士林首席研究员结合当代中药材面临的困境，以及团队的研究方向和科研成果，为大家带来了一场精彩纷呈的讲座。[15]

陈士林在上海中医药大学举办讲座
陈士林在上海中医药大学举办讲座

成都中医药大学首席教授、中国中医科学院中药研究所首席研究员陈士林，因在本草基因组学研究做出的突出贡献，于2022年10月28日分别当选为俄罗斯工程院和俄罗斯自然科学院外籍院士。[8]

2023年4月26日，陈士林回到母校湖北中医药就《本草纲目全本图典》编译工作开展沟通交流。[16]9月11日，为期两天的“2023第八届诺贝尔奖获得者医学峰会暨数智医疗论坛”在成都举行。论坛上，陈士林关注数字技术驱动下的中医药研究，他认为有两个机遇，一是数字技术驱动能提高中医药的诊疗水平，第二个机遇在于将人工智能用于新药发现，可大大提高新药发现速度，提高对传统中医药疗效的评价效率。[17]11月22日，陈士林当选中国工程院院士。[2]

2024年2月，成都中医药大学陈士林院士团队与北京化工大学童贻刚团队及合作者在国际著名综合类期刊《自然—通讯》上发表了题为千金藤素类似物挖掘和千金藤属基因组研究加速了抗冠状病毒药物发现的研究性论文。[18]

主要成就

国际上首创核基因组序列ITS2作为中草药通用DNA条形码的鉴定技术体系，纳入《中华人民共和国药典》，主编《中国药典中药材DNA条形码标准序列》等专著，从基因层面解决千百年来中草药物种真伪鉴定难题，被世界中医药学会联合会誉为标志着“中药进入标准化的基因鉴定时代”；[2]同时，被评为2016中国十大医学进展。[9]创立“本草基因组学”学科，开发药用动/植物高通量混合测序的全基因组组装及拼接技术并成功突破复杂基因组组装难题，国际上率先完成510个中药基原物种核基因组和细胞器基因组图谱，揭示中草药品质形成遗传密码。[2]通过全基因组解析提出灵芝为首个中药基原药用模式真菌，被Nature China选为中国最佳研究亮点推介。[9]完成并发表人参、丹参、赤芝、菊花、卷柏、穿心莲、紫芝、紫苏、黄连、红豆杉黄花蒿等全基因组图谱和相关组学研究。[9]基于多组学技术构建中药材品质提升工程技术体系，建立全世界规模最大的药用植物种质迁地保护专业平台，获得紫苏、三七、人参等新品种证书8个，已在农田生产中推广应用，突破了中药材优良品种选育关键技术。[2]主编中国第一部《本草基因组学》《药用植物分子遗传学》并由科学出版社出版，奠定中国药用植物分子遗传学基础。[2]完成并编著《中国中药材产地生态适宜性数值区划》，避免中药材盲目引种栽培。[9]陈士林团队依托在云南文山的一家三七科技园，在构建了基于基因组学的“四阶式”新品种选育平台之后，成功选育出来三七新品种、发展优质三七药材，每年解决20万人次的农民就业，带动3500户农民脱贫致富。[19]

获国家发明专利和美国专利授权38项，发表论文500余篇，其中SCI论文300余篇，包括国际著名期刊Nature Plants， Nature Communications， PNAS等，论文被引用3万余次。[9]陈士林院士团队与北京化工大学童贻刚团队及合作者在国际著名综合类期刊《自然—通讯》上发表了题为千金藤素类似物挖掘和千金藤属基因组研究加速了抗冠状病毒药物发现的研究性论文，系统揭示了千金藤素天然生物合成途径中系列代谢产物的广谱抗冠状病毒活性，为加速抗冠状病毒药物开发提供了坚实基础。[18]

主要论文

名称作者发表刊物发表年份中药资源的可持续利用陈士林,郭宝林世界科学技术2004[10]中国中药资源可持续发展体系构建陈士林,苏钢强,邹健强,黄林芳,郭宝林,肖培根中国中药杂志2005[10]基于DNA barcoding(条形码)技术的中药材鉴定陈士林,姚辉,宋经元,李西文,刘昶,陆建伟世界科学技术-中医药现代化2007[10]中药资源创新方法研究陈士林,谢彩香,姚辉,宋经元,孙超世界科学技术-中医药现代化2008[10]中药DNA条形码鉴定体系及研究方向陈士林,庞晓慧,姚辉,韩建萍,罗焜kūn世界科学技术-中医药现代化2011[10]中药基因组学与合成生物学陈士林,朱孝轩,李春芳,王勇,姚辉,孙超,宋经元药学学报2012[10]中药鉴定学新技术新方法研究进展陈士林,郭宝林,张贵君,严铸云,罗光明,孙素琴,吴和珍,黄林芳,庞晓慧,陈建波中国中药杂志2012[10]Genome sequence of the model medicinal mushroomGanoderma lucidumShilin Chen*.; Xu, J.; Liu, C.; Zhu, Y.; Nelson, D. R.; Zhou, S.; Li, C.; Wang, L.; Guo, X.; Sun, Y.; H Luo, Y Li, J Song, B Henrissat, A Levasseur, J Qian, J Li, X Luo, L Shi, LHe, L Xiang, X Xu, Y Niu, Q Li, Mira V. Han, H Yan, J Zhang, H Chen, A Lv, ZWang, M Liu, David C. Schwartz & C Sun*Nature communications2012[20]中药材DNA条形码分子鉴定指导原则陈士林,姚辉,韩建萍,辛天怡,庞晓慧,石林春,罗焜,宋经元,侯典云,石上梅,钱忠直中国中药杂志2013[10]现代生物技术在人参属药用植物研究中的应用陈士林,朱孝轩,陈晓辰,牛云云,张鑫,宋经元,罗红梅,孙超中国中药杂志2013[10]中药精准煮散饮片陈士林,黄志海,丘小惠,莫结丽,张志杰,李西文世界科学技术-中医药现代化2016[10]中药饮片标准汤剂研究策略陈士林,刘安,李琦,杉田享,朱广伟,孙奕,代云桃,章军,张铁军,友田健久,刘昌孝中国中药杂志2016[10]Genome analysis of the ancient tracheophyte Selaginella tamariscinareveals evolutionary features relevant to the acquisition of desiccation toleranceZ Xu, T Xin, Dorothea Bartels,Y Li, W Gu,H Yao,S Liu,H Yu,X Pu, J Zhou, J Xu, C Xi ,H Lei Jingyuan Song,Shilin ChenMol Plant2018[21]Herbal genomics: Examining the biology of traditional medicinesChen S*, Song J, Sun C, Xu J, Zhu Y, Verpoorte R, Fan TP*Science2015[22]Incipient diploidization of the medicinal plant Perilla within 10,000 yearsZhang YJ, Shen , Leng , Zhang , Chen , Shi YH, Ning ZM, Chen SL*Nature Communications2021[22]Analysis of the Coptis chinensis genome reveals the diversification of protoberberine-type alkaloidsLiu Y, Wang B, Shu S, Li Z, Song C, Liu D, Niu Y, Liu J, Zhang J, Liu H, Hu Z, Huang B, Liu X, Liu W, Jiang L, Alami MM, Zhou Y, Ma Y, He X, Yang Y, Zhang T, Hu H, Barker MS, Chen S*, Wang X, Nie JNature Communications2021[22]Single-cell RNA sequencing provides a high-resolution roadmap for understanding the multicellular compartmentation of specialized metabolismSun S, Shen X, Li Y, Li Y, Wang S, Li R, Zhang H, Shen G, Guo B, Wei J, Xu J, St-Pierre B, Chen S*, Sun CNature plants2023[22]Publisher Correction: Omniphobic liquid-like surfacesLiwei Chen,Shilin Huang,Robin H. A. Ras &Xuelin Tiannature reviews chemistry2023[23]Characterization of the horse chestnut genome reveals the evolution of aescin and aesculin biosynthesisWei Sun,Qinggang Yin,Huihua Wan,Ranran Gao,Chao Xiong,Chong Xie,Xiangxiao Meng,Yaolei Mi,Xiaotong Wang,Caixia Wang,Weiqiang Chen,Ziyan Xie,Zheyong Xue,Hui Yao,Peng Sun,Xuehua Xie,Zhigang Hu,David R. Nelson,Zhichao Xu,Xinxiao Sun &Shilin Chen Nature Communications2023[24]

社会任职

中国工程院院士中国医学科学院学部委员国际欧亚科学院院士“濒危药材繁育国家工程实验室”主任中国药学会中药与天然药物专业委员会主任委员美国药典传统中药咨询组顾问教育部长江学者创新团队负责人CGCM(中药全球化联盟)副主席中国质量协会中药分会会长Pharmaceutical Crops共同主编CHM、《药学学报》副主编PLOS ONE等国际刊物编委香港浸会大学荣誉教授日本东京药科大学客座教授俄罗斯自然科学院外籍院士、俄罗斯工程院外籍院士--

参考资料：[10][2]

所获荣誉

时间荣誉
2020年5月第二届全国创新争先奖奖章[11]
-国家科技进步二等奖2项[10]
-中华中医药学会自然科学一等奖[10]
-教育部高校成果科技进步一等奖[10]
-吴阶平医药创新奖[2]
-Agilent Thought Leadership Award[2]
-诺奖之星[2]
-入选Elsevier高被引中国学者榜单[2]
-入选“终身科学影响力排行榜(1960-2019)”[2]

相关评价

陈士林研究员是中药资源与鉴定研究领域著名学者，完成1万余种中药材及混伪品的DNA条形码研究，国际上率先提出并证实核基因序列ITS2作为药用植物通用DNA条形码，创建了全新的中药材DNA条形码鉴定技术体系，为中草药建立了“基因身份证”，解决了中国几千年来中药材物种真伪鉴定方法缺陷的难题，建立了药材基因鉴定系统标准，为中药鉴定学开拓了新的方法学领域。（吴阶平医学基金会 评）[31]

陈士林长期从事中药研究，构建药用植物种质迁地保护专业平台、 国家药用植物种质资源库、 国家濒危药材繁育工程实验室等， 重点解决中药品质等影响临床用药安全有效的核心问题。从生态、生物学表型、遗传角度揭示中药材品质形成机制的科学内涵，发表的药用植物全基因组论文总数国际第一。（川观新闻 评）[32]

主要著作

introduction《中国药材产地生态适宜性区划》是2011年6月1日科学出版社出版的图书，作者是陈士林。本书是一部中药材产地适宜性研究与实践的学术专著。
名称中国药材产地生态适宜性区划
publisher科学出版社[25]
时间2011-06-01
名称中国药典中药材DNA条形码标准序列
publisher科学出版社[26]
时间2015-02
名称中药饮片标准汤剂（第一卷）
publisher科学出版社[27]
时间2018-01-01
名称本草基因组学
publisher科学出版社[28]
时间2018-08
名称中药饮片标准汤剂（第二卷）
publisher科学出版社[29]
时间2018-11
名称药用植物分子遗传学
publisher科学出版社[30]
时间2022-06

参考资料 32

  1. 关于公布中国工程院2023年院士增选有效候选人名单的公告 — 中国工程院
  2. 成都中医药大学陈士林教授当选中国工程院院士 — 中国新闻网
  3. 荆门荣耀!陈士林当选中国工程院院士 — 云上荆门
  4. 祝贺!湖北中医药大学1978级中药学专业杰出校友陈士林教授当选中国工程院院士 — 湖北中医药大学招生办公室
  5. 热烈祝贺我校杰出校友陈士林当选中国工程院院士 — 荆门市龙泉中学
  6. 叶祖光、陈士林被聘任为中国中医科学院首席研究员 — 中国中医科学院中药研究所
  7. 陈士林当选欧亚科学院院士 — 中国中医科学院中药研究所
  8. 成都中医药大学首席教授陈士林当选俄罗斯工程院和俄罗斯自然科学院外籍院士 — 四川新闻网
  9. 祝贺!中医人陈士林、朱立国当选2023年中国工程院院士 — 中国互联网新闻中心
  10. 陈士林 — 中国医药信息查询平台
  11. 热烈祝贺我校杰出校友陈士林荣获“第二届全国创新争先奖章” — 成都中医药大学
  12. 陈士林赴意大利参加第七届世界卫生组织传统医药合作中心主任会议 — 中国中医科学院中药研究所
  13. 2017中国西部生物医药大会开幕 全球生物医药精英“ 智汇” 成都医学城 — 四川频道
  14. 陈士林参加“香港中药研发研讨会2017”并做大会报告 — 中国中医科学院中药研究所
  15. 中国中医科学院陈士林首席研究员应邀来我院讲学 — 上海中医药大学中药学院
  16. 中国中医科学院首席研究员陈士林来校开展《本草纲目全本图典》编译工作交流会议 — 湖北中医药大学
  17. 未来已来 中医药也要搭AI快车 — 金台资讯
  18. 成都中医药大学发现抗冠状病毒新化合物 — 今日头条
  19. 陈士林:脱贫攻坚需科技“授人以渔” — 科协之声
  20. Genome sequence of the model medicinal mushroom Ganoderma lucidum — NATURE COMMUNICATIONS
  21. Genome analysis of the ancient tracheophyte Selaginella tamariscina reveals evolutionary features relevant to the acquisition of desiccation tolerance — molecular plant
  22. 陈士林 — 成都中医药大学
  23. Publisher Correction: Omniphobic liquid-like surfaces — nature
  24. Characterization of the horse chestnut genome reveals the evolution of aescin and aesculin biosynthesis — nature
  25. 中国药材产地生态适宜性区划 — 中国权威的出版物数据服务平台(PDC)
  26. 中国药典中药材DNA条形码标准序列 — 中国权威的出版物数据服务平台(PDC)
  27. 中药饮片标准汤剂（第一卷） — 中国权威的出版物数据服务平台(PDC)
  28. 本草基因组学 — 中国权威的出版物数据服务平台(PDC)
  29. 中药饮片标准汤剂（第二卷） — 中国权威的出版物数据服务平台(PDC)
  30. 药用植物分子遗传学 — 中国权威的出版物数据服务平台(PDC)
  31. 2015年吴阶平医药创新奖获奖者王俊教授、王建安教授、陈士林研究员 — 吴阶平医学基金会
  32. 祝贺！四川新增5位两院院士，有这些科学家入选→ — 川观新闻

注释

  1. 截至2023年11月23日。
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