于1998年毕业于中国医科大学七年制外文系,获得医学学士学位;2003年3月毕业于日本神户大学,获得医学博士学位;2003年6月至2008年7月在美国哈佛医学院细胞生物系从事博士后研究;2008年7月起任中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所研究员,博士生导师和研究组长。
人物经历
1998年,程红毕业于中国医科大学七年制外文系,获得医学学士学位。[1]1998年9月至2003年6月,她就读于日本神户大学,[2]毕业后获得医学博士学位。2003年6月至2008年7月,程红在美国哈佛医学院细胞生物系从事博士后研究。[1]2008年7月至2020年4月,她任中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所研究员,博士生导师。2020年4月起,程红任中国科学院分子细胞科学卓越创新中心研究员,博士生导师。[2]
主要成果
研究工作 真核细胞中,基因表达是一个多步骤的,复杂的过程,它是从转录和新生mRNA前体(pre-mRNA)的核内加工过程开始的。这些加工过程包括5’端加帽(capping),剪接(splicing),和3´端加多聚腺苷酸尾(polyadenylation)等一系列步骤。这些步骤完成之后,成熟的mRNA才能被转运出核翻译成蛋白质。基因表达通路中的每个步骤是由不同的机器来完成的,而这些步骤之间又是通过这些机器中的蛋白质之间的直接作用藕连在一起的。这样的藕连机制可以保证基因表达高效而准确地完成。mRNA出核是基因表达通路中的重要步骤和关键环节,它是由结合在mRNA上的mRNA输出器(TREX)与位于核膜孔的mRNA出核受体(TAP/P15)之间的相互作用来介导完成的。mRNA的出核过程直接影响真核细胞的生长、增殖、分化、发育等多种生命活动。许多重要疾病的发生与发展,例如肿瘤和病毒感染,都与mRNA出核异常密切相关。
研究项目
本研究组的主要研究方向是基因表达的调控与功能,至今着重研究RNA出核的调控与功能,并计划扩展到基因表达中的其它步骤。我们的研究包括两个大的方面:
1. 真核细胞mRNA出核的调控与功能:mRNA出核的分子机制;mRNA出核与基因表达其它步骤的偶联;mRNA输出器(TREX复合体)的表达调控与功能。
主要作品
| 序号 | 论文名称 | 发表刊物 | 发表时间 |
|---|---|---|---|
| 1 | CDK11 requires a critical activator SAP30BP to regulate pre-mRNA splicing | EMBO J | 2023年 |
| 2 | Myogenesis controlled by a long non-coding RNA 1700113A16RIK and post-transcriptional regulation | Cell Regeneration | 2022年 |
| 3 | Structural and functional insights into R-loop prevention and mRNA export by budding yeast THO-Sub2 complex | Science Bulletin | 2021年 |
| 4 | ZFC3H1 prevents RNA trafficking into nuclear speckles through condensation | Nucleic Acids Research | 2021年 |
| 5 | Axon-enriched lincRNA ALAE is required for axon elongation via regulation of local mRNA translation | Cell Reports | 2021年 |
| 6 | Alternative 3 UTRs play a widespread role in translation-independent mRNA association with the endoplasmic reticulum | Cell Reports | 2021年 |
| 7 | Out or decay: fate determination of nuclear RNAs | Essays in Biochemistry | 2020年 |
| 8 | The micropeptide LEMP plays an evolutionarily conserved role in myogenesis | Cell Death Dis | 2020年 |
| 9 | A Pandas complex adapted for piRNA-guided transcriptional silencing and heterochromatin formation | Nature Cell Biology | 2019年 |
| 10 | New means to an end: mRNA export activity impacts alternative polyadenylation | Transcription | 2019年 |
| 11 | The mRNA export receptor NXF1 coordinates transcriptional dynamics, alternative polyadenylation, and mRNA export | Mol Cell | 2019年 |
| 12 | NRDE2 negatively regulates exosome functions by inhibiting MTR4 recruitment and exosome interaction | Genes Dev | 2019年 |
| 13 | A U2 snRNP independent role of SF3b in promoting mRNA export | Proc Natl Acad Sci USA | 2019年 |
| 14 | ALYREF links 3’-end processing to nuclear export of non-polyadenylated mRNAs | EMBO J | 2019年 |
| 15 | Intronless mRNAs transit through nuclear speckles to gain export competence | J Cell Biol | 2018年 |
| 16 | mRNAs are sorted for export or degradation before passing through nuclear speckles | Nucleic Acids Res | 2018年 |
| 17 | Structural insight into precursor tRNA processing by yeast ribonuclease P | Science | 2018年 |
| 18 | Microinjection and fluorescence in situ hybridization assay for studying mRNA export in mammalian cells | Methods Mol Biol | 2017年 |
| 19 | ALYREF mainly binds to the 5’ and the 3’ regions of the mRNA in vivo | Nucleic Acids Res | 2017年 |
| 20 | Exosome cofactor hMTR4 competes with export adaptor ALYREF to ensure balanced nuclear RNA pools for degradation and export | EMBO J | 2017年 |
| 21 | The effect of codon mismatch on the protein translation system | PLoS One | 2016年 |
| 22 | Cheng H*. Premature termination codons are recognized in the nucleus in a reading-frame dependent manner | Cell Discov | 2015年 |
| 23 | A sub-element in PRE enhances nuclear export of intronless mRNAs by recruiting the TREX complex via ZC3H18 | Nucleic Acids Res | 2014年 |
| 24 | Aly and THO are required for assembly of the human TREX complex and association of TREX components with the spliced mRNA | Nucleic Acids Res | 2013年 |
| 25 | Atypical PKC, regulated by Rho GTPases and Mek/Erk, phosphorylates Ezrin during eight-cell embryo compaction | Dev Biol | 2013年 |
| 26 | Role of nuclear receptor coactivator 3 (Ncoa3) in pluripotency maintenance | J Biol Chem | 2012年 |
| 27 | mRNA Export | Encyclopedia of Life Sciences | 2007年 |
| 28 | Human mRNA export machinery recruited to the 5’ end of mRNA | Cell | 2006年 |
| 29 | TREX, SR proteins and export of mRNA | Curr Opin Cell Biol | 2005年 |
| 30 | Recruitment of the human TREX complex to mRNA during splicing | Genes Dev | 2005年 |
| 31 | Role of the Rab GTP-binding protein Ypt3 in the fission yeast exocytic pathway and its connection to calcineurin function | Mol Biol Cell | 2002年 |
| 32 | Calcineurin is implicated in the regulation of the septation initiation network in fission yeast | Genes to Cells | 2002年 |
注:表格资料来源[1]
社会职务
| 时间 | 担任职务 |
|---|---|
| 2020年3月31日 | 《生命的化学》编委 |
| 2019年9月1日 | 上海市生物化学与分子生物学学会理事 |
| 2012年11月1日 | 中国生物化学与分子生物学学会RNA专业委员会副主任 |
注:表格资料来源[2]
主讲课程
程红主讲的课程是:分子生物学。[2]
荣誉
程红先后获得国家杰出青年科学基金和上海市“浦江人才计划”支持。2024年3月6日,程红研究员获上海市科技系统三八红旗手荣誉称号。[3]
参考资料 3
- 程红 — 中国科学院分子细胞科学卓越创新中心(生物化学与细胞生物学研究所)
- 程红 — 中国科学院大学
- 分子细胞科学卓越创新中心程红研究员和孙丽明研究组获上海市科技系统三八红旗手(集体)表彰 — shb.cas