生物信息学

《生物信息学》是由刘娟主编，高等教育出版社2014年出版的普通高等教育“十一五”国家级规划教材。该书作为生命科学、计算机科学等相关专业的教材使用，也可供相关科研人员参考使用。全书共分十一章，主要介绍了相关数据库和软件的功能、应用策略和使用方法等内容，具体内容包括核酸与蛋白质序列数据资源、序列比较与相似序列搜索、分子系统发育分析、基因组结构注释、蛋白质结构分析、蛋白质序列分析、Microarray基因表达数据分析、蛋白质组数据分析、生物信息学在疾病相关基因与药物发现中的应用，以及生物信息导航资源等。

《生物信息学》由来自4所高校的7位教师编写而成，具体分工如下：第一、二、三章由华中科技大学陆枫编写，第四章由西北农林科技大学马闯编写，第五章由华中科技大学李论、陆枫编写，第六章由华中科技大学段谟杰和武汉大学罗飞编写，第七章由华中科技大学陆枫和武汉大学刘娟编写，第八章由中南民族大学周到、华中科技大学陆枫和武汉大学刘娟编写，第九章由武汉大学刘娟、罗飞和华中科技大学陆枫编写，第十章由武汉大学刘娟、罗飞和华中科技大学李论、陆枫编写，第十一章由武汉大学罗飞编写。全书所有章节由刘娟统稿并编撰习题。刘娟和罗飞对该书全部内容进行了校对审核。

《生物信息学》全书共分11章，主要介绍了相关数据库和软件的功能、应用策略和使用方法等。其中第一章介绍了生物信息学的发展历史和该书的主要内容；第二章介绍了常用的序列数据库资源及如何从数据库中获取序列数据；第三章介绍了序列比对的基本概念、经典的序列比对算法以及有关序列对工具的使用方法等；第四章介绍基因结构的预测方法和Ensembl的基因组结构注释流程；第五章系统发生树的基本概念以及分子系统发生树的构建方法；第六章介绍了蛋白质结构的相关知识以及蛋白质结构的预测方法；第七章介绍了蛋白质序列分析方法与蛋白质功能预测方法；第八章介绍了微阵列数据的有关概念和微阵列数据的分析方法；第九章主要介绍了蛋白质质谱数据分析方法和蛋白质－蛋白质互作预测方法等；第十章主要介绍了疾病相关的数据资源和疾病基因发现的生物信息学方法；第十一章介绍了SNP芯片及深度测序的基本概念；其次，各章都配有一定数量的思考题。

《生物信息学》有配套的数字课程，该课程包括全书彩图、重要数据库链接和简介、重要生物信息统计分析软件功能简介、科学故事四大类。

该书围绕生物信息学研究与应用的主要内容，以实例介绍了相关数据库和软件的功能、应用策略和使用方法。该书综合介绍了生物信息学研究解决的问题、基本方法、现有成果与存在的问题。该书各章都配有一定数量的思考题。

刘娟，武汉大学计算机学院教授，是《生物信息学》的主编。