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日本国立大学（英文：Japanese National University），是由日本国家政府直接设立的大学，由国家全额出资建立。自2004年4月1日起，根据《国公立大学法》，所有日本国立大学均成立了独立的日本国立大学法人组织。目前，日本共有86所国立大学。2016年，日本政府开始评选部分最高水平的国立大学，并将其命名为指定国立大学，以进一步促进日本国立大学系统的改革。2020年4月，名古屋大学和岐阜大学的国立大学法人将合并为同一个东海国立大学机构，以共同管理这两所国立大学。这一新的国立大学法人管理模式将有助于促进日本国立大学系统的进一步改革。
办学条件
日本的高等教育机构根据设立主体的不同，可以分为国立、公立、私立三种。国公立大学中，国立大学总数为86所、公立大学91所，基本上都是一流大学。国公立大学与私立大学不能设置硕士学位点和博士学位点不同，国公立大学都设有硕士和博士学位点。国公立大学由日本政府设立，学费较私立更低廉（50%），同时国公立大学有数量少、招生严格等特点，考取难度较私立大学难度更大、世界学术排名和知名度更高。
在2016交大日本大学排行榜中前10位中均为国立和公立大学。
2012年TIMES世界排中，TOP200中有将近10所日本大学入选。日本国公立大学都设有大学院（研究生院），开设硕士、博士课程。就读日本国立大学大学院的学生持有留学签证，申请奖学金、享受医疗保险、就业、交通费折扣等方面较私立大学拥有更多的报销政策和优惠补贴。
在专业方面，日本国公立大学的设置也比较齐全。其中，既有东京大学、京都大学、东北大学、大阪大学等知名度高的综合性大学，也有东京工业大学、京都工艺纤维大学、北九州市立大学等侧重某些专业的大学，更有大阪教育大学、政策研究大学院大学、奈良先端科学技术大学院大学等综合排名不高，但在某些具体领域代表了教育最高水平的学校。
机构设置
大学里的“大学院”是实施研究生教育的机构，有硕士（学制2年）、博士（学制3年）学位授予权。有些学校硕士课程和博士课程分别设立，有些学校是合在一起设立，分博士课程前期2年，博士课程后期3年，前期课程2年也视为硕士课程。
“学部”是实施本科教育的机构，有学士学位授予权。本科一般4年，医科6年（含牙医、兽医，毕业后可直接报考4年制博士研究生课程）。
短期大学和高等专门学校只能实施大学专科教育，学制2-3年，颁发专科毕业证书，不能授予学位。
在学部和大学院里，除攻读学位的正规学生外，还有“旁听生”、“履修生”和“进修生”。这三类学生都不能获得毕业证书或学位证书，只有“履修生”修读的学分被承认。学部不招收“研究生”。
办学优势
• ・国公立大学的教育水平与世界排名更高。
• ・费用更低廉、学费每年53万日元（约4万人民币）左右；部分学校还有有学费减免，可以再次减半。 ・奖学金种类更多，申请成功几率更大。
• ・可以合法打工；
• ・毕业后就业前景好；
• ・部分大学提供英文授课项目。
86所国立大学
日文名称中文名称北海道大学北海道大学北海道教育大学北海道教育大学室兰工业大学室兰工业大学小樽商科大学小樽商科大学帯広畜产大学带广畜产大学旭川医科大学旭川医科大学北见工业大学北见工业大学弘前大学弘前大学岩手大学岩手大学东北大学东北大学宫城教育大学宫城教育大学秋田大学秋田大学山形大学山形大学福岛大学福岛大学茨城大学茨城大学筑波大学筑波大学筑波技术大学筑波技术大学宇都宫大学宇都宫大学群马大学群马大学埼玉大学埼玉大学千叶大学千叶大学东京大学东京大学东京医科歯科大学东京医科齿科大学东京外国语大学东京外国语大学东京学芸大学东京学艺大学东京农工大学东京农工大学东京芸术大学东京艺术大学东京工业大学东京工业大学东京海洋大学东京海洋大学お茶の水女子大学御茶水女子大学电気通信大学电气通信大学一桥大学一桥大学横浜国立大学横滨国立大学新潟大学新潟大学长冈技术科学大学长冈技术科学大学上越教育大学上越教育大学富山大学富山大学金沢大学金泽大学福井大学福井大学山梨大学山梨大学信州大学信州大学岐阜大学岐阜大学静冈大学静冈大学浜松医科大学浜松医科大学名古屋大学名古屋大学爱知教育大学爱知教育大学名古屋工业大学名古屋工业大学豊桥技术科学大学丰桥技术科学大学三重大学三重大学滋贺大学滋贺大学滋贺医科大学滋贺医科大学京都大学京都大学京都教育大学京都教育大学京都工芸繊维大学京都工艺纤维大学大阪大学大阪大学大阪教育大学大阪教育大学兵库教育大学兵库教育大学神戸大学神户大学奈良教育大学奈良教育大学奈良女子大学奈良女子大学和歌山大学和歌山大学鸟取大学鸟取大学岛根大学岛根大学冈山大学冈山大学広岛大学广岛大学山口大学山口大学徳岛大学德岛大学鸣门教育大学鸣门教育大学香川大学香川大学爱媛大学爱媛大学高知大学高知大学福冈教育大学福冈教育大学九州大学九州大学九州工业大学九州工业大学佐贺大学佐贺大学长崎大学长崎大学熊本大学熊本大学大分大学大分大学宫崎大学宫崎大学鹿児岛大学鹿儿岛大学鹿屋体育大学鹿屋体育大学琉球大学琉球大学政策研究大学院大学政策研究大学院大学総合研究大学院大学综合研究大学院大学北陆先端科学技术大学院大学北陆先端科学技术大学院大学奈良先端科学技术大学院大学奈良先端科学技术大学院大学
91所公立大学
名寄市立大学
札幌医科大学
神戸市外国语大学
长崎県立大学
秋田県立大学
会津大学
埼玉県立大学
大分県立看护科学大学
宫崎県立看护大学
冲縄県立看护大学
冲縄県立芸术大学
新潟県立大学
石川県立大学
山形県立保健医疗大学
山形県立米沢栄养大学
福岛県立医科大学
茨城県立医疗大学
群马県立県民健康科学大学
群马県立女子大学
千叶県立保健医疗大学
产业技术大学院大学
神奈川県立保健福祉大学
新潟県立看护大学
石川県立看护大学
金沢美术工芸大学
敦贺市立看护大学
名古屋市立大学
静冈県立大学
爱知県立大学
长野県看护大学
岐阜県立看护大学
情报科学芸术大学院大学
静冈文化芸术大学
爱知県立芸术大学
三重県立看护大学
滋贺県立大学
京都市立芸术大学
福知山公立大学
神戸市看护大学
兵库県立大学
奈良県立大学
和歌山県立医科大学
香川県立保健医疗大学
爱媛県立医疗技术大学
高知工科大学
高知県立大学
名桜大学
名寄市立大学短期大学部
岩手県立大学盛冈短期大学部
川崎市立看护短期大学
长野県短期大学
静冈県立大学短期大学部
岛根県立大学短期大学部
大分県立芸术文化短期大学
鹿児岛県立短期大学
岛根県立大学
冈山県立大学
新见公立大学
県立広岛大学
広岛市立大学
福山市立大学
山口东京理科大学