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故宫研究院是对故宫博物院已有的学术研究力量的整合。是故宫博物院设立的学术研究与交流的非建制机构。2013年10月23日，故宫研究院正式挂牌。
下设书画研究所，陶瓷研究所，古建筑研究所，藏传佛教文物研究所，文博法治研究所，考古研究所，古文献研究所，宫廷戏曲研究所，明清宫廷制作技艺研究所，宫廷园艺研究所，中国画法研究所，中外文化交流研究所，研究室，故宫学研究所，明清宫廷历史档案研究所。
2018年10月，故宫研究院中医药文化研究所举行揭牌仪式。
目标
据故宫研究院院长、故宫博物院原院长郑欣淼介绍，研究院采用项目管理的方式，为院内外、国内外相关领域的专家学者搭建开放的平台，就某一具体问题开展有针对性的研究。
故宫研究院力争在三至五年的时间内，逐步形成具有一定规模的学术团队，初步完成具有理论体系的学术建设。在实践上，以灵活可行的人事制度吸纳学术人才，形成学术梯队，启动和完成一批国家级、省部级科研项目，出版一批高质量的学术专著，提升故宫博物院在国际博物馆界的学术声誉，与著名高校、科研院所保持密切的合作关系和学术联系，使故宫博物院的综合研究能力可与重点高校比肩，走在国内前列。
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故宫研究院 将对清宫廷文化和院藏文物、档案进行研究，下设一室一站四所五中心，即研究室、博士后科研工作站、故宫学研究所、考古研究所等。故宫博物院2013年7月获准成立故宫博物院博士后科研工作站，是我国首次在文博系统设博士后工作站。
郑欣淼任院长。该院将组成“老专家牵头，青年人参与”的学术队伍。