叶万军先后主持国家自然科学基金2项,教育部“新世纪人才支持计划”项目1项,陕西省科学研究发展计划项目1项,陕西省自然科学基金1项,教育部重点实验室基金及其他横向合作课题5项,教育部“新世纪优秀人才支持计划”项目负责人,获得“陕西省青年科技科技新星”的荣誉称号。近两年来,在国家自然科学基金及教育部重点实验室基金项目的资助下,以黄土崩塌灾害为对象,研究黄土体在温度梯度下的水热迁移特性,在卸荷作用下的节理裂隙扩展规律,探索黄土崩塌灾害形成的机理。获得国家发明专利3项,在核心以上刊物发表论文20篇,其中EI收录8篇,ISTP收录2篇,合作出版专著《黄土侵蚀工程地质》,独立出版专著《黄土路堑高边坡优化设计研究》。