反向重复序列

反向重复序列指两个序列相同的拷贝在DNA链上呈反向排列，是DNA重复序列的一种类型。反向重复序列散布在整个基因组中，约占人类基因组中占5%，常见于基因的调控区，可能与基因的转录、复制有关。反向重复序列的一种形式是反向排列的两个拷贝间隔着一段序列，另一种形式是两个拷贝之间没有间隔序列，呈反向串联，这种结构又称回文式序列。起始序列和反向互补序列之间的核苷酸插入序列可以是任何长度，包括零。例如，5'---TTACGnnnnnnCGTAA---3' 是反向重复序列。而当插入序列长度为零时，该复合序列为回文序列。反向重复和定向重复序列均构成重复出现的核苷gān酸序列的类型。

反向重复序列 (inverted repeat sequence)：GTGCTAA和TTAGCAC构成反向重复序列。在双链DNA中反向重复可能引起十字形结构的形成。上面的序列为反向重复序列，同时，注意到它两条链顺读是一样的，且中间没有间隔序列，因此它是回文序列。

回文结构（palindromic structure）：在真核细胞染色质DNA分子中，还存在大量特殊的序列，这种结构中脱氧核苷酸的排列在DNA两条链中顺读与倒读其意义是一样的，脱氧核苷酸的排列对于一个假象的轴成180°旋转对称，这种结构称为回文结构。

几种重复序列辨析（非正式名词解释）：

反向重复序列(Inverted repeat sequence)5'AAAANNNNTTTT3'3'TTTTNNNNAAAA5'两条链中以5'->3'方向读出来是一样的，两条链旋转对称回文序列(Palindromic sequence)5'AAAATTTT3'3'TTTTAAAA5'当反向重复序列中没有“NNNN”时就称为回文序列，两条链旋转对称正向重读序列(Direct repeats sequence)5'ATCGNNNNATCG3'3'TAGCNNNNTAGC5'在同一条序列中有重复(NNNN的前后序列都是AAAA)，中间的NNNN可有可无镜像重复序列(Mirror repeats)5'ATCGNNNNGCTA3'3'TAGCNNNNCGAT5'两条链都呈轴对称