三域系统

三域系统是由卡尔·乌斯(Carl Woese)在1977年提出的细胞生命形式分类，将原核生物分成了两大类，起初称为真细菌（Eubacteria）和古细菌（Archaebacteria）。Woese依据16S rRNA序列上的差别，认为这两类生物和真核生物一起从一个具有原始遗传机制的共同祖先分别演化而来，因此将三者各置为一个“域”（Domain），作为比“界”高一级的分类系统，并分别命名为细菌域（Bacteria）、古菌域（Archaea）和真核域（Eukarya）。

然而，rRNA树有可能将演化太快的类群放错位置（比如微孢子虫）。有人认为生物的根应该在真细菌之内，很多真细菌的类群在古细菌之前分支出来，很晚古细菌和真核生物才彼此分开。

Woese依据16S rRNA序列上的差别﹐认为这两组生物和真核生物从一个具有原始遗传机制的共同祖先分别进化而来﹐因此将三者各划为一类﹐作为比界高的分类系统，称作“域”(Domain)或者“总界”(Superkingdom)。1990年，Carl Woese为了避免把古细菌也看作是细菌的一类，又把 三域目前这三域改称为细菌(Bacteria)﹑古生菌(Archaea)和真核生物(Eukarya)。

然而﹐RNA树有可能将进化太快的类群放错位置(比如微孢子虫)。有人认为生物的根应该在真细菌之内﹐很多真细菌的类群在古细菌之前分支出来﹐很晚古细菌和真核生物才彼此分开。

三域特征比较-特征细菌(Bacteria)古菌(Archaea)真核生物(Eukarya)形态和遗传原核细胞结构是是否共价闭合环状DNA是是否组蛋白无有有被膜包被的核无无有细胞壁含细胞酸不含细胞酸不含细胞酸膜脂质酯zhǐ键连接醚键连接酯键连接核糖体大小70S70S80S起始tRNA甲酰蛋氨酸蛋氨酸蛋氨酸多数基因中有内含子否否是操纵子有有无mRNA加帽和聚A尾无无有质粒有有稀少核糖体对白喉毒素敏感否是是RNA聚合酶1个（4亚基）几个(各8~12亚基）3个（各12~14亚基）需要转录因子否是是启动子结构-10和-35序列TATA框TATA框生理产甲烷作用无有无硝化有无无脱氮有有无固氮有有无基于叶绿素的光合作用有无有（在叶绿体中）基于视紫红质的能量代谢有有无化能无机营养（Fe, S, H2）有有无气泡有有无聚-β-羟基脂肪酸作为碳储存颗粒有有无在80℃以上生长有有无