《泽卡贝因NOT》是由著名动漫《泽卡贝因》改编的动作射击游戏第二作,在与人类的谜之敌“ガルズオルム”的战斗中,主人公“トガ・デュープ”参加了月面作战。不幸的是,トガ并没有安全返回,而被ガルズオルム回收,当他醒来时记忆已经全部丧失,如今的他正作为ガルズオルム的机师卷入了新的战火之中。因此,本作将从敌方的角度为玩家揭开2006年夏季发售的《泽卡贝因XOR》故事中未曾解开的各种谜团。游戏中玩家依然将驾驶泽卡贝因在各种各样的舞台上战斗,游戏中机体自定义功能十分强大,一共有3000种以上的组合可能,同伴、技能、颜色连接的组合不同也会影响机体性能的变化。