有《香港教会办学初探》、《学校宗教教育新路 向》、Changing Paradigms of Christian Higher Education in China;另主编丛书有《中国教会大学历史文献研讨会论文集》、《中国教会大学文献目录》(共五辑)及《基督教教育与中国社会丛书》(共七辑);并在 《近代史研究》、《文史哲》、《学人》、《近代中国史研究通讯》、《近代中国基督教史研究集刊》、《教育研究学报》等期刊发表学术论文30余篇。2002 年,吴教授被美国三藩市旧金山大学利玛窦中西文化历史研究所聘任为该所2002年度杰出院士。